来自Sigma的该酶已被用于开发用于离体培养小鼠胚胎乳腺芽的实验方法。它已被用于在从大鼠心脏分离线粒体的过程中对大鼠心脏碎片进行处理。它还被用于通过酶水解来分离牙髓干细胞（DPSC）。这些细胞已与通过外植体方法分离的DPSC进行了比较，以分析它们的干细胞和分化特性。
中性蛋白酶II已被用于荧光激活细胞分选（FACS）。它还被用于分离内脏卵黄囊层。