凯杰Qiagen代理,miScript II RT Kit,货号218160

使用miScript PCR System,对包含miRNA的总RNA进行逆转录

凯杰Qiagen miScript II RT Kit (12) 218160

上海金畔生物科技有限公司提供凯杰Qiagen miScript II RT Kit (12) 218160,品质保证,价格优惠,全国联保,欢迎咨询。

灵敏和特异性的检测miRNA

利用单一cDNA定量检测多种miRNA

利用同一cDNA定量检测miRNA和mRNA

利用同一cDNA定量检测成熟miRNA和miRNA前体

专有技术合成RNA,评估逆转录效率

miScript II RT Kit是miScript PCR System的重要组成部分,用于miRNA定量检测。配合miScript SYBR Green PCR Kit和miScript PCRarrays(miRNome或Pathway-Focused miScript miRNA PCR Arrays)或所需的检测(用于miRNA或其他非编码RNA的miScript Primer Assays、用于miRNA前体的miScript Precursor Assays或用于mRNA的QuantiTect Primer Assays),miScript II RT Kit合成的cDNA可作为real-time PCR 的模板。

Performance

miScript II RT Kit配合miScript PCR System的其他组分,灵敏和特异性地检测并定量miRNA。由于许多miRNA表达水平低,灵敏度特别重要,以确保数据的可靠。miScript PCR System灵敏度高、动态范围广和持续高扩增率。其卓越的性能使得初次尝试时即可获得高度重复性结果(参见”Reproducible results in technical and biological replicates”)。

高特异性

miRNAs存在许多miRNA亚型家族,有些只是单个碱基的不同。这使得miRNA定量面临很大挑战。miScript PCR System可有效识别紧密相关的miRNA亚型,即使是只有单个碱基不同的miRNA也可(见表)。

 

miScript PCR System的特异性

miRNA序列
Let-7b UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
Let-7c UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
miR-98 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
Let-7d AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGUU
Let-7e UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGUU
Let-7a UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
Let-7f UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU
Let-7g UGAGGUAGUAGUUUGUACAGUU
Let-7i UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGUU

 

用于PCR的cDNA Let-7b Let-7c miR-98 Let-7d Let-7e Let-7a Let-7f Let-7g Let-7i
Let-7b 100.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01
Let-7c 0.54 100.00 0.00 0.00 1.01 0.12 0.00 0.00 0.00
miR-98 0.00 0.21 100.00 0.06 0.01 0.05 0.00 0.01 0.13
Let-7d 0.05 0.02 0.00 100.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.01
Let-7e 0.05 0.01 0.00 0.02 100.00 0.23 0.00 0.00 0.01
Let-7a 0.07 0.64 0.00 0.54 3.86 100.00 0.06 0.04 0.02
Let-7f 0.55 0.12 0.01 0.11 0.03 1.05 100.00 0.14 0.13
Let-7g 0.58 0.17 0.01 0.08 0.00 0.04 0.01 100.00 0.17
Let-7i 0.13 0.02 0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.10 100.00

Let-7亚型的RNA序列已列出。粗体有下划线部分为碱基变化。使用miScript II RT Kit和miScript HiFlex Buffer,每个Let-7亚型(Let-7a-Let-7i和miR-98)的合成miRNAs用于cDNA合成反应。相同的实验也可使用miScript HiSpec Buffer,获得相同的结果(数据未列出)。不同cDNA的等分试样作为real-time PCR反应的模板,配合适合不同亚型miScript Primer Assay和miScript SYBR® Green PCR Kit使用。%相对检测值为所有与miScript Primer Assays不匹配和匹配的CT值的差值(%相对检测值= 2-ΔCT x 100)。其值表明miScript PCR System有效识别紧密相关的亚型家族的能力。

Principle

miScript PCR System应用SYBR Green-based real-time PCR,能够灵敏和特异性地进行miRNA的定量和谱分析。miScript PCR System可以完成从RNA中合成cDNA及后续的real-time PCR检测miRNAs涉及的所有步骤。

miScript PCR System包含以下组分:

miScript II RT Kit,可简单、单步合成cDNA。单个cDNA合成反应可用于检测数以百计的miRNAs。双缓冲体系满足使用real-time PCR进行miRNA定量的独特要求。

miScript SYBR Green PCR Kit,包含QuantiTect SYBR Green PCR Master Mix和反向引物miScript Universal Primer,配合miScript Primer Assay或miScript miRNA PCR Array进行miRNAs检测。

miScript Primer Assay或miScript Precursor Assay,前者为miRNA特异性正向引物,用于检测成熟miRNAs。后者包含正向和反向引物,靶向作用于miRNA前体的颈环序列。该产品使用miRBase中的最新序列信息设计。

miScript miRNA PCR Array,miRNome或Pathway-Focused miScript miRNA PCR Arrays被预先设定,单次使用的PCR孔板/孔盘可快速分析成熟miRNAs。

miScript miRNA PCR Array data analysis tool,免费的基于网络的工具,简化了用于miScript miRNA PCR Arrays相对定量的ΔΔCT方法。

miScript II RT Kit双缓冲体系

miScript II RT Kit包含miScript Reverse Transcriptase Mix、10x miScript Nucleics Mix、5x miScript HiSpec Buffer和5x miScript HiFlex Buffer。miScript Reverse Transcriptase Mix是一种经优化的poly(A)聚合酶和逆转录酶混合物。miScript Nucleics Mix包含dNTPs、rATP、oligo-dT引物和内部合成RNA对照(miRNA逆转录对照[miRTC]),可评估使用miScript miRNA PCR Arrays进行谱分析实验的逆转录性能(获取更多信息,请参考miScript miRNA PCR Array Handbook)。

miScript II RT Kit提供两种缓冲液:miScript HiSpec Buffer和miScript HiFlex Buffer,满足使用real-time PCR进行miRNA定量研究的特别要求(参见”miScript II RT Kit buffers”)。miScript HiSpec Buffer配合miScript miRNA PCR Arrays和miScript Primer Assays进行成熟miRNA谱分析和定量实验时,提供理想的结果。miScript HiFlex Buffer适合于低通量miRNA定量实验,从同一样本进行如miRNA、mRNA和前体miRNA等不同种类的RNA的定量实验除外。

 

miScript HiSpec Buffer进行逆转录实验

使用miScript HiSpec Buffer进行逆转录反应,确保成熟miRNAs的选择性转化,miScript PCR Controls靶向转至cDNA。使用oligo-dT引物,成熟miRNAs通过poly(A)聚合酶加尾后,被逆转录至cDNA(参见”Selective conversion of mature miRNAs into cDNA in miScript HiSpec Buffer”)。加尾和逆转录在同一试管内同时进行。oligo-dT引物有一个3’退化锚点和一个在5’端的通用标签序列,可在real-time PCR步骤扩增成熟miRNA。miScript Primer Assays配合miScript SYBR Green PCR Kit,确保通过real-time PCR灵敏、特异性的定量miRNA。加尾和通用标签保证miScript Primer Assays不会检测到基因组DNA。

 

miScript HiFlex Buffer进行逆转录实验

使用miScript HiFlex Buffer进行逆转录反应,可使所有种类的RNA转化至cDNA(参见”Simultaneous conversion of all RNA species into cDNA in miScript HiFlex Buffer”)。使用oligo-dT引物,成熟miRNAs通过poly(A) 聚合酶加尾后,被逆转录至cDNA。加尾和逆转录在同一试管内同时进行。oligo-dT引物有一个3’退化锚点和一个在5’端的通用标签序列,可在real-time PCR步骤扩增成熟miRNA。miScript Primer Assays配合miScript SYBR Green PCR Kit,确保通过real-time PCR定量miRNA。加尾和通用标签确保miScript Primer Assays不会检测到基因组DNA。其它种类RNA(包括miRNA前体、其它非编码RNA和mRNA)使用oligo-dT和随机引物转化至cDNA。配合miScript SYBR Green PCR Kit,使用合适的检测进行real-time PCR的RNAs检测(如用于非编码RNA检测的miScript Primer Assays 、用于miRNA前体检测的miScript Precursor Assays和用于mRNA检测的QuantiTect Primer Assays)。

Procedure

逆转录反应操作简单。包含miRNA的总RNA作为逆转录反应的起始材料。逆转录是一个简单的流程,包括在37oC条件下进行1个小时的孵育反应及在95oC条件下的简单孵育后进行的灭活反应。

Applications

miScript II RT Kit作为miScript PCR System的一部分,用于:

成熟miRNA定量检测和谱分析

同时检测miRNA和mRNA

同时检测成熟miRNA和miRNA前体

检测snoRNA和其他非编码RNA

凯杰Qiagen代理,石蜡包埋组织miRNA和总RNA纯化试剂盒 miRNeasy FFPE Kit,货号217504

从福尔马林固定、石蜡包埋的组织切片中进行miRNA和总RNA的纯化

上海金畔生物科技有限公司提供凯杰Qiagen 石蜡包埋组织miRNA和总RNA纯化试剂盒 miRNeasy FFPE Kit (50) 217504,品质保证,价格优惠,全国联保,欢迎咨询。

有效纯化miRNA和总RNA

创新方法用于克服福尔马林造成的交联

有效释放RNA而不会破坏其完整性

85分钟流畅的操作得到RNA

miRNeasy FFPE Kit确保从福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的组织切片中纯化含约18个核苷酸以上的总RNA。试剂盒能够回收可用的RNA片段,包括miRNA和其他小RNA,用于定量real-time RT-PCR等下游应用。

Performance

使用miRNeasy FFPE Kit纯化的总RNA和miRNA的产量和性能优于采用其他方法纯化的miRNA,如使用苯酚-氯仿抽提或者其他供应商的类似试剂盒(参见”Effective real-time RT-PCR quantification”、”Efficient RNA purification from FFPE tissues”和”Superior yields and performance”)。

Principle

用福尔马林固定的组织导致RNA-RNA和RNA-蛋白质交联,从而影响了RNA在下游应用中的表现。miRNeasy FFPE Kit提供了独特的裂解和孵育条件,可逆转福尔马林对RNA造成的交联。特别研制的的裂解缓冲液有效地将RNA从组织切片中释放出来,同时避免了RNA的进一步降解。裂解产物用DNase消化,然后优化的结合条件能够纯化含约18个以上核苷酸的所有可用的RNA。

Procedure

所有的miRNeasy FFPE操作流程都可在85分钟之内完成。优化的裂解缓冲液能够用蛋白质酶K消化样本裂解产物,仅需15分钟而且不损耗RNA产量。裂解后,在80°C下孵育样本15分钟逆转福尔马林交联。然后,在优化的DNase消化步骤中,用DNase Booster Buffer快速去除基因组DNA,并且用RNeasy MinElute离心柱纯化浓缩的RNA(参见”miRNeasy FFPE procedure”)。由于RNA的洗脱体积仅有14–30 µl,在下游应用中可实现较小的反应体积。

Applications

miRNeasy FFPE Kit能够纯化包含miRNA的总RNA,并且适用于多种下游应用,如定量real-time RT-PCR。

Features

Specifications

应用

PCR, qPRC, real-time RT-PCR, microArray

洗脱体积

14-30 µl

规格

Spin column

主要样本类型

FFPE tissue samples

处理

Manual (protocol for automated processing on QIAcube available)

纯化总RNA、miRNA、poly A+ mRNA、DNA或蛋白

miRNA, total RNA

样本量

up to 4 sections, each with a thickness up to 10 µm and a surface area up to 250mm^2 (automated protocol on QIAcube: up to 2 sections)

技术

Silica technology

产量

Varies

应用

PCR, qPRC, real-time RT-PCR, microArray