ChIP-Seq 核裂解液品牌:JinPan | 货号:JP-8145-100ml
ChIP-Seq Nuclear Lysis buffer
【保存条件】
-20 ℃保存,有效期 12 个月
【概述】
本品适用于小片段(5-500bp)单链 DNA 的杂交反应,获得更优质的杂交双链 DNA 片段,如 shRNA、gRNA 载体等构建。
【操作方法】
1. 收获细胞核后,将细胞核重悬于 3-5 倍体积的冰冷的 ChIP-Seq 核裂解缓冲液中(5 倍体积取决于细胞核 提取过程中细胞裂解液用量,如细胞裂解液用量为 100µl 则加入 500µl ChIP-Seq 核裂解液)
2. 将试管在冰上孵育 20 分钟。
3.从每个样品中取 5 µL 等分试样,并用 15 µL TE 稀释以用于分析凝胶确认。(注:将剩余保存在冰上或 冻-20 ℃,直到需要为止。该样品用于确认染色质在分离前是完整的。)
4. 将试管放入设定为 2°C 的超声浴中, 调节水位,使管子刚好接触杯垫的表面。。 如用 Misonix 431A 对每个试管进行 300 µl 的超声处理非常稳定,因此我们建议将较大的样品分成多个试管进行超声处理。将至少两个和多达 8 个试 管放入超声仪的试管支架中。
5. 用 10 秒的脉冲和 10 秒的静止时间以 20 的振幅对样品进行超声处理,总超声时间为 30 分钟。
6. 从超声仪中取出样品,并保存在冰上。
7. 取 5 µl 样品,并用 15 µl TE 稀释以用于分析凝胶。
8. 在 37°C 下,用 10 µg RNase A 样品 15 分钟。
9. 在 65°C 下用 20 µg 蛋白酶 K 样品 30 分钟。
10. 在 95°C 下反向交联 5 分钟,使样品缓慢冷却至室温。 需要执行这些步骤以确保 DNA 在琼脂糖凝胶上的正确迁移。否则,将发生比预期高得多的分子量的涂污或迁移。
11. 将加样染料添加到每个样品中,并在 TAE 运行缓冲液中的 1%琼脂糖凝胶上分离样品。
12. 凝胶成像仪下观察琼脂糖凝胶上的 DNA 样品。 剪切染色质的大小应在 200 至 500 bp 之间。
13. 若步骤 12 完成后鉴定可行,将步骤 6 中其余样品在 4°C 下以 16,000 g 的速度离心 10 分钟,以去除不 溶物。
14. 将可溶的剪切染色质转移到新鲜的 1.5ml 离心管中。 染色质可以在液氮中冷冻,并在-80°C 下保存直至需要。
15.按上述方法用 RNase A,蛋白酶 K 和交联逆转处理等分试样(步骤 8-10)。
16.使用 QIAquick PCR 纯化试剂盒纯化染色质,并使用 NanoDrop 等测量 DNA 浓度。
【注意事项】
1. 如果每次的使用量很小,可以适当分装后再使用,以免污染。
2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
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